柯南在警方、fbi、日本公安、ss的帮助下，黑衣组织被铲除殆尽。只是，在兰逝世之后，再也没有莎朗和贝尔摩德的踪影。
半个月后：
柯南和小五郎的生活开始沉闷，妃英理也搬了回来结束了分居生活。这段时间无论是妃法律事务所还是这家毛利侦探事务所都暂时歇业了。只是不到20天的时间，事务所越来越冷清。另一边的阿笠博士家也是如此，没有了少年侦探队（步美、元太在吃了aptx4869后，并没有将情况告诉柯南错过了治疗时间，药效发作后，他们并没有像柯南和灰原那样幸运。）、灰原每天把自己关到地下室，博士也劝说不了。每天发明工具的动力与乐趣也随着孩子们的消逝而消失。工藤优作和有希子暂时回到了家中居住。而冲矢昴也就是赤井秀一已经回到了fbi，与茱蒂一起回到了美国，水无怜奈也回去了cia，降谷零也不再ポアロ打工了，ss的王彬也返回了中国。服部还会经常来东京，但和叶再也没有在跟随，园子也好久没有来了。世良真纯也好久没有出现了，听由美说，似乎和赤井一起回到了美国。（为什么会听由美说呢？最近的情况表明，羽田秀吉可能是世良真纯的二哥）
平淡的一天：
柯南又去往博士家查看灰原的做药进度，自从小兰为灰原挡下了莎朗的子弹后，柯南对灰原没有了往日的调侃和配合，更多的是斥责和催促。灰原也没有办法、没有能力反驳，而每次几乎都是博士劝停了柯南单方面的责备。灰原还在地下室工作，她每天只有博士睡去后才去吃点东西，好久了，她没有看见外面的世界了。柯南其实知道自己不该责备谁，但好像无法说服自己可以做什么。今天到博士家没多久，他就走了。
不过，他没有回家，没有回事务所，他去了一个地方，一个拥有它们共同回忆的地方——轻井泽。他从耳语小道走到礼拜堂，正好，今天也举行了婚礼，这是他第一次幻想与小兰结婚的场景。然后他又一个人在云场池踱步，抬头看着银杏，没有一丝光芒，他看的如此真实。最后他来到水鸟岛，看着纯白的天鹅振翅飞去，他在那里顿了顿。“ol-guy！”柯南回头看，真是苦艾酒“苦艾酒！”“ol-guy，想她了吗，anl？”“你怎么在这里？”苦艾酒坐在他旁边，一边撩动着头发，一边说：“我最近一直在你身边，想对你说几句话，只是一直找不到机会。今天看见你没有返回事务所，所以跟你到了这里。”柯南忽然激动起来：“告诉我，莎朗在哪里？”苦艾酒抽起了烟，吐了一口烟云：“她早就走了。”“去了哪里？”“放心吧，你再也见不到她了。”柯南吃了一惊：“什么？！难道”苦艾酒又是淡淡一笑：“今天我之所以到这里，是想告诉你，我们的恩怨已经了解了，我也要走了。”说罢，苦艾酒将烟丢掉，用脚踩灭。柯南望着她：“你去哪儿？”苦艾酒站起身看着他：“不知道，不过日本应该不会回来了，毕竟我的手可是沾满了我母亲的鲜血。”“苦艾酒”苦艾酒一个人走离，忽然又回头说：“酷小子，同样都是女人的我，想告诉你，不要讲错归结于她，她也是受害者，你不该这样，如果哪一天你失去她，你一定会后悔。珍惜她！”柯南迟疑了一会儿，“苦艾酒！你为什么为什么要帮我们？”苦艾酒再次笑了起来，戴上头盔，骑上了她的v-rod，对柯南说：“a-secret-ake-a-oen-oen。”柯南看着苦艾酒走远，良久，“灰原”