也就在武则天和李晨就李贤之事交流了一番后的第三天，朝廷再发诏令，废黜参与谋逆的李贤一切职爵，并将将幽禁于宫中的李贤流放到房州；改立英王李显为太子，并大赦天下。￡∝，
李贤身边的近臣大多都是反对武则天干政的，原本武则天就对这些人非常不满，借着李贤“谋逆”案起的机会，武则天借机发动清洗。
太子心腹，位列政事堂的宰相张大安贬为普州刺史，参加审查此案的高知周也因为与李贤有交往，被迫提出了辞呈，告老还乡去了。太子洗马刘讷言被流振州，而赵道生等人则被斩首示众。
李贤是个热情奔放的人，王公大臣中好友众多，这些人也都遭到了武则天的打击。
曹王李明蒋王李炜东阳公主，这几位与李贤交往甚官的皇室子弟，全部流放出京。
曹王李明蒋王李炜是李世民的儿子，李治的弟弟，李明还是武则天表姐巢剌王妃杨氏唯一的儿子，最终李明在武则天的逼迫下，自杀身亡。
蒋王李炜被降封为零陵王，贬至黔州，就是后来贵州那地方。
东阳长公主是李世民的第九女，下嫁高士廉之子高履行，因为长孙无忌之案，东阳公主已经被处罚过一次，此次因为与李贤过密的交往而被牵连，被剥夺邑封，和两个儿子徙置巫州。
高家同样再受武则天的重处，她对高家的处置，堪称手段达到了极致。
高士廉是长孙无忌和长孙皇后的舅舅，长孙无忌一案中高家已经深受打击，但世家大族毕竟根深叶茂，后来李治也有意和解。所以还是有不少人担任高官。高士廉生有六子，其中高审行高真行在朝中任要职。高审行任户部侍郎，高真行为左卫将军。
高真行之子高政，是东宫属官，任太子典膳丞，被牵连到李贤案上。武则天顾及李治的“面子”，把高政交给其父高真行处理。早被武则天那冷酷清除异己手段个半死的高家长辈，保全高家，他们用最血腥的方式来表示和参与谋逆的至亲划清界限。
倒霉的高政没受到朝廷的处置，但他得“特赦”后刚一进门，他的父亲高真行就用佩刀刺向他的咽喉，伯父高审行一刀砍入他的小腹，高履行的儿子高政的堂兄高琁挥刀砍下他的头颅。高政被杀死后，他残缺不全的尸体被至亲的亲人扔到了大街上。弃之不理。
高家如此血腥对待高政，让武则天也目瞪口呆，有些不敢相信。
让武则天更意外的是，皇帝李治被高家长辈这样冷血残酷举动彻底激怒，马上下旨重处高家，将高政的父亲高真行和伯父高审行及一道行凶的堂兄高琁统统贬出京。高真行贬为睦州刺史，高审行为渝州刺史，高琁则被发配到安西大都护府其他高家的子弟及家眷也全被赶出京。
显赫一时的高家就这么破败下去。再也没有机会翻身了，世家大阀的力量遭到了沉重的打击。要是高士廉泉下有知。说不定会从棺材里跳出来，大骂武则天及不成器的高家子嗣一顿。
朝中的力量因为李贤谋逆案而重新整合，在追查此案时候，迎合了武则天意的薛元超被提为中书令，裴炎因为在查案中坚持定李贤的谋逆罪名，深得武则天的赞赏。被晋职为检校侍中，武则天亲自提拔上来的李敬玄，被授以为检校中书令，并被封赵国公。