后燕虽然起步很快，慕容垂振臂一呼，就有大批将士归于麾下、大片领土收入囊中，但到了后来扩张的阶段，战争频繁，兵役劳役沉重，百姓缺衣少食，民间一片哀苦，反对的声音也越来越响，于是平定各处叛乱，成了后燕的日常。
385年中，慕容垂让鲁王慕容和担任南翼禁卫指挥官，镇守邺城，然后让骠骑大将军慕容农，穿过居庸关北上，一路经过凡城，直指龙城，集结各路兵马，讨伐叛将建节将军余岩。
一波未平，一波又起，余岩之乱尚未平息，南部的绎幕县人蔡匡，占领县城也宣告叛变，抚军大将军慕容麟和冠军大将军慕容隆，联合出兵镇压。
绎幕县紧临东晋疆域，东晋泰山郡长任泰，暗中出动军队，援救蔡匡。
城池久攻不下，而外援双到，无燕将领纷纷担忧，认为蔡匡之乱不可能立刻平定了，慕容隆却发现了好机会，召开紧急会议，传达了这一思想：“蔡匡仗恃他有外援，所以坚守不屈，一时难以攻下，现在计算任泰的部队，不过数千人，趁他们内外还没有会师，我们应该急行攻击，只要打败任泰，蔡匡失去幻想，自然就会投降。”
将士们悄然大悟，于是解除对蔡匡的包围，转而向任泰发起猛攻，最终大破晋军，杀敌一千多人，蔡匡果然献城投降。
慕容垂早已被叛将惹毛了，毫不含糊地斩了蔡匡，并把蔡匡的所有部众屠杀干净。
与此同时，骠骑大将军慕容农，已率军抵达龙城，先安排人马休息十多天，然后再向叛军发动攻击。
将领们都不理解，派代表提出质疑：“殿下北上时，行军迅速，可是到眼看离贼人却来越近，却又停顿不进，原因何在？”
慕容农胸有成竹地说：“我之所以很快地赶路，只是担心余岩翻过大山，大肆抢掠，伤害了善良的居民，现在停顿不前，那是因为我知道余岩的才能十分平庸，只不过是诱骗一些饥饿的民众，像乌鸦一样聚集在一起，并没有严格的纪律，只要扼住了他的咽喉，拖的日子一久，他的军队就会自己离散，不可能有所作为。”
将士们无不点头称赞，慕容农接着解释：“正值丰收时节，这里的农作物都已成熟，没有收割就离开，白白损耗自己的军粮，我准备把这里的庄稼收割完毕，再前往厮杀，前后也不过多等十天而已。”
没过不久，慕容农便率步骑兵三万人，南下进攻令支，余岩部众大为惊骇，许多人偷偷翻出城墙投奔慕容农，余岩最后也不得不束手就擒，被慕容农斩杀。
平定了余岩，慕容农乘胜进攻高句丽王国，收复了辽东、玄菟等地，志得意满之后，重回龙城，上疏请求整修祖先的坟墓祭庙。
慕容垂得知前线大胜，高兴之余，加授慕容农使持节、幽平以及北狄军区司令长官、幽州州长，镇守龙城，另让让平州督导官、带方王慕容佐，镇守平郭。
慕容农制订的法条政令宽厚简约，司法清廉公正，减少田赋捐税，鼓励耕种，督促养蚕，百姓生活日渐富足，数万名逃亡四方的难民也都前来投奔，为后燕北部边疆的稳定做出了突出贡献。
之前乐浪王慕容温在中山屯积了大量粮秣，还修建了豪华的宫殿，如今解决了后顾之忧，慕容垂便于本年12月23日，下令把中山作为国都，以避开西面和南面敌人的威胁。
次年春天，后燕朝廷迁都完成，慕容垂一改燕王称号，正式登极称帝。