弗瑞无法从洛基口获得任何关于宇宙魔方的信息，明明洛基是阶下之囚，可是却耐他不得，毕竟他是托尔的弟弟，粗暴的手段行不通。弗瑞不能只将希望寄托于斯塔克身上，他必须做点什么。
于是，在弗瑞的授意下，身为顶级间谍的黑寡妇妇娜塔莎·罗曼诺夫展开浑身解数，企图从洛基口出套出他的目的。但所有的努力都是枉然的。
由于绿巨人的缺席，洛基的意图并没有轻易暴露出来，所以NPC们至今仍然蒙在鼓。宇宙魔方的下落仍然没有丝毫进展。
另一方面，实验室的托尼·斯塔克与美国队长发生了微微的争执。与原剧情不二，斯塔克怀疑弗瑞的动机，于是在刚登上母舰的时候斯塔克的贾维斯智能系统就已经开始破解神盾局的加密件，他想看看弗瑞究竟隐瞒着什么。
罗杰斯起先只是不满于托尼·斯塔克那种嘻嘻哈哈的风格，可是在同斯塔克的一番争论下来，罗杰斯心也起了疑心。于是也来不及等斯塔克的智能系统破解进度完毕，直接摸进了神盾局的加密件储存室，寻找自己想要的信息。
很快，罗杰斯便拎着一把利用宇宙魔方制造出来的先进武器从件库里走了出来。
“斯塔克，找到宇宙魔法了吗？”
弗瑞突然走进斯塔克的实验室，向他询问搜查成果。
“在找着。搜索模型已经锁定，正在扫描搜索信号。”坐在电脑屏幕前的斯塔克指了指弗瑞身后的地球投影，“一有结果，就能把范围缩小至八百米内。”
弗瑞顺着斯塔克所指方向望去，斯塔克继续道。
“然后你就能拿回魔方，稍安勿躁。”斯塔克正说着，他面前的电脑屏幕突然“叮”了一声，斯塔克扭头一看，原来是贾维斯成功破解了神盾的加密件。
一个名为Phase2阶段2的计划书出现在斯塔克面前。
“第二阶段是什么？”斯塔克一边翻阅着获取的信息一边问向弗瑞。
“第二阶段是神盾局利用魔方的无限能源制造武器。”这时，美国队长罗杰斯扛着一把银白sè的重枪样本走入实验室，他将手那把利用宇宙魔方制成的枪械往桌子上一搁，看着斯塔克道：
“对不起，我等不起计算机了。”
“听着，罗杰斯……”弗瑞还想狡辩，但是发现新大陆的斯塔克开口打断了他的狡辩。
斯塔克将屏幕上的一张关于大规模杀伤xìng武器的计划图纸推到众人面前，“弗瑞，你还想怎么编？”
与此同时，雷神托尔和黑寡妇也同时走进了实验室，
“解释一下，神盾局要干嘛？利用宇宙魔方开发大规模杀伤xìng武器？”斯塔克质疑出声。
弗瑞沉默了半晌，终于抬起手，指着刚刚走进实验室的托尔：“因为他。”
“我？关我什么事？”托尔有些无辜的看着弗瑞，一场剧烈的口水战马上就此揭开序幕。但是，实验室内的所有人都没发现，摆放在他们身后的洛基权杖忽然发出了一阵微微的光芒。将弗瑞、斯塔克等人的具体坐标发送到正在向母舰驶来的一艘飞机之上。
“66B运输机，请上报确认口令。系统有你的资料，但没有航行记录，请上报运输货物，完毕。”
“武器弹药，完毕。”
舰桥环形座位上，能天使队人环坐在圆桌前，通过桌上的显示器观看复仇者联盟NPC们最为激烈的口水战。所有人都知道，剧情的转折点就要到了。被洛基黑化的鹰眼侠巴顿会带着一支队伍攻入神盾局母舰内部，造成神盾局阵脚大乱。不仅救出了洛基，还杀了科尔森、设计托尔，将他关入原本关押洛基的封闭舱，然后让他从千米的高空坠落。而且，巴顿还使用电子干扰箭关闭了母舰的引擎，差点导致母舰坠毁。
也正是这一次契机的磨合，让复仇者联盟这个充满了矛盾和英雄主义的团队走向成熟。