在离开了粉红神奇宝贝之岛后，小智他们继续着他们的旅程。
“天气晴朗，海浪稳定，真的在好不过了，对不对啊，大家”，小霞抱着波克基古对着在海里的自己的四只神奇宝贝说道。
“照这个情况来看，水温应该会上升，海里的神奇宝贝应该会出来游泳才对哦”，小建这时也放下一直拿着的望远镜说道，“啊，有东西过来了”，在又用望远镜看着前方，小建突然说道，然后就有两艘快船贴着小智的乘龙过去了，当然大家也被溅起的水淋成了落汤鸡。
“撞到人怎么办啊”，小霞在船过去后立刻气愤的喊道。
“船开的那么快干什么啊？”这时小建不解的说。
“那艘船应该是到那座小岛上”，小智看到这儿就知道马上就要去化石盔之岛了，所以说道。
“难不成那里有什么事吗？”小霞看着远方的小岛说道。
“谢谢你，乘龙，回来吧”，到了小岛后，小智收回了乘龙，“伊布，出来吧”，随后又放出了两只伊布，而皮丘和波克基古看到伊布后，就高兴的和它们一起玩去了。
‘电视剧前的各位观众，我们现在终于为了各位观众，找到了这个又问题的岛上了，到了这个无人岛，相信对于绝种的神奇宝贝化石盔的谜题将会有进一步的了解，我们待会将会和提前登陆发掘调查队会合，和他们一同进行采访行动’，这时那边传来了这样的声音，小智等人看过去就发现好像是在进行现场直播。
“化石盔的秘密”，在那些人走后，小建重复的说道。
“我们去看看吧”，既然到了这里，那就去看看，于是小智说道。
“好啊”，小霞也同意的说。
‘为了进行正式的发掘调查，他们已经在这里设置了扎营基地’，走到了一个大帐篷那儿，就听到之前的采访记者说道，‘大家看到了，就是这次造成话题的化石盔的化石’，然后她指着一块化石继续说，‘这是几天前，一名渔夫用渔网捕获的，根据专家鉴定，现在已经确实，这就是货真价实的化石盔，经过了多方鉴定的结果，最后终于得知，它们是从这个小岛上漂流出去的’。
“太好了，真正的化石盔化石耶”，听完那个人的话，小建高兴的说。
“有什么好稀奇的，小刚就有一只活的化石盔”，而小霞这时则是对着小建说道。
“什么，活的化石盔，这怎么可能”，小建听到后立马不可置信的说。
“有什么不可能的，你不是看到我的菊石兽了吗，而且小智还有一只镰刀盔、一只多刺菊石兽和一只化石翼龙呢”，小霞立刻说道。
“对哦，你有菊石兽”，小建这时想到小霞的菊石兽后说道。
“什么，小智，你有这些神奇宝贝”，突然反应过来小霞的后半句话后，小建抓着小智说道，“你一定要让我看看啊”。
“他们现在都在大木博士研究所呢，反正你以后要去，到时候在看吧，我会让你好好观察的”，小智想都没想的说。
“那我们还在这儿参与这次的发掘活动吗？”小霞这时说道。
“反正都来了，就一起去看看吧”，小智想了想后说道。
‘现在我们就请发掘调查队的队长来跟大家说明此次行动的目的，队长请’，这时那边的采访记者继续说道。
“来了”，然后就从帐篷中出来了一位少女。
“乔伊小姐？”看清出来的少女的长相后，小霞和小建惊讶的说道。
‘这次发掘调查的主要目的，是调查化石盔这种绝种的神奇宝贝的生态，并且解开与化石盔的精髓有关的秘密’，而这时，乔伊小姐已经对着镜头开始说了。
‘化石盔的精髓的秘密’，采访的记者重复说。
‘很久以前就有传说，化石盔的精髓能够制造长生不老药，一直流传在各地，我们希望能够找到大量的化石盔化石，只要能解开这个谜题，对于促进医学的进步一定很有帮助’，乔伊小姐解释说。
‘原来如此’，采访记者最后说道。
“乔伊小姐，我们也想参加这次的活动，可以吗？”小智一行人走上前后，对着乔伊说道。
“好了，给位，准备出发了”，乔伊答应了小智他们参加这次的活动，随后就要出发了。
‘确认化石盔化石可能在海口之后，调查队出发了，不知道这一次能不能如愿的找到化石，我们一定会尽全力为大家做详细的报道’，而采访的记者也跟着做追踪报道了。
一路上，卡蒂狗在前方寻路，豪力在中间背着东西，而小智他们就跟在最后面。
‘我们现在慢慢的往森林里前进，到底调查队此行能不能顺利的到达海口处呢’。
“汪、汪”，在走过了峭壁上的险路又走上森林中的路后，这时，前方的卡蒂狗突然叫了起来。
“怎么了，卡蒂狗”，控制卡蒂狗的那个人不解的说。
“出了什么事情吗？”而乔伊小姐这时过去问道。
“卡蒂狗的样子好像不太对劲耶”，那个人解释说。
“怎么会呢，这里看起来没什么啊”，乔伊小姐看着周围说道。
“啊————————”，这时突然前方陡坡上的一块球形的大岩石滚了下来，大家都开始向后跑。
‘这下事情严重了，我们到底能不能顺利的脱逃呢’，采访记者还不忘的说道。
“波克基古快点过来”，小霞看到后也对着波克基古说道，“叫尅古~”，波克基古听到后立刻飞着跟上了小霞。
“伊布，使用挖洞，把地面挖松”，小智这时对着身边的两只伊布下令说。
‘啊，伊布使用了挖洞绝招，真是太厉害了’，看着陷进地面的大石块和刚从地里出来的两只伊布，记者激动的喊道，‘各位观众，这次多亏了伊布的帮助，才成功让我们摆脱了危机’。
“辛苦你们了”，小智摸了摸伊布，说道。
“好，继续前进”，随后乔伊小姐又说道，大家也继续前进了。
“终于到了”，在又走了一段路之后，小智等人终于到达了目的地。
‘终于到达了，超越了难以想象的困难之后，我们一行人终于到达了目的地，岛上的海口处，而且发掘队一到这里就开始展开了发掘调查，铁甲暴龙和豪力正在协助工程的进行，大家同心协力下，能不能够找到化石盔的化石呢，这个结果太令人期待了’。
而小智等人则是坐在一边休息。
“皮丘~”，可是就在这时突然上方掉下来好多的岩石。
“大家快逃”，乔伊小姐立刻喊道。
“皮丘，使用铁尾，伊布，双重影子球”，小智则是立刻下令皮丘和伊布使用绝招，皮丘和伊布也都把岩石给打碎了。
“铁甲暴龙，把岩石破坏掉，豪力，挡下岩石”，看到小智的神奇宝贝把岩石打碎后，乔伊也立刻让铁甲暴龙和豪力来挡住岩石。
‘不得了了，这次是皮丘的铁尾、伊布的影子球、铁甲暴龙的角钻和豪力手刀把岩石击碎了，我们又赢了’，采访记者又激动的说道。
“现在的岩石崩塌和刚才的大岩石，看起来好像是有人要对付我们耶”，在危险结束后，小霞想了想后说道。
“哪会呢，只是巧合罢了”，小建则是认为是巧合。
“叫尅古~”，这时波克基古好像发现了什么似的，叫了一声，就向一个方向飞去。
“波克基古，你要去哪里啊”，小霞看到波克基古飞了出去，于是喊道。