烛阴利用人类心的欲念，控制蛊惑了许多心神不坚定的人类为他服务，这些人被称为“魔使”。
统领人类的是被称为“炎帝”“黄帝”的两位领，他们两人本是人类最大两个部族的领，之间互有争斗，然而面对烛阴强大的力量，他们携手共同组成了人类同盟，遵从伏羲的指挥。
争斗之初，魔使毕竟是少数，无法抵抗强大的人类同盟，炎黄的部队节节胜利，一路北进。
炎帝手下有两员大将，一名蚩尤，一名刑天，这两人都是掌握了至高武学战技的骁勇战将，都具有以一敌百的强横战力，实力直逼神魔。
然而过度追求极限的力量，心积郁的对杀戮和嗜血的渴望渐渐迷惑了他们的心智，被烛阴利用和控制，最终堕入魔道，挥刀反目，人类联盟大败。
经此一役，许多人类武者渐渐明白了一味追求武力的局限性，强大的武力带来的嗜血和杀戮的负面情绪正是烛阴最佳的突破口，无数人类就是这样迷失了自我而误入魔道。
于是人类武者渐渐提出了“修心”的武学理念，强调强韧坚定的内心辅以高的武学技巧，并逐渐形成组织，史称“武魂”。
此外，那些因自身因素无法修习武学和法术的人类，也逐渐找到了自身的展方向，专研各种机关术数，成为了一个特殊的存在，被称之为“百宝神机”。
至此，神机、武魂、玄奇、筑华共同出力，构成了髅大的战力，使得人类战场上，伏羲一方略胜一筹。
然而在混沌空间之，伏羲以一己之力对抗烛阴据比渐渐有所不及，为了维持盘古大陆的封印伏羲向天吴、毕方、西子、帝俊出请求，希望他们能够出手帮助维持大陆的安定。
四极本也不希望烛阴、据比渐渐做大，加上担心天地核心被控制后会对自身所处空间造成影响，以及性情温婉的女娲本就曾对众神魔多有恩惠于是决定联合以助伏羲。
然而四极不愿直接出手，自损实力。
于是天吴和毕方暂停彼此间无休止的摩擦和争斗，合池水火风四灵法力为天地本元之力，去增强伏羲封印的威力。
西子和帝俊稳定彼此空间和盘古大陆的联通口，阻止烛阴和据比的神力入侵。
随后四极又并合天地神力，采山之铜铸造出了一把绝世神兵一指天剑，又名轩辕剑。
剑身一面刻日月星辰一面刻山川草木。
剑柄一面书农耕畜养之术，一面书四海一统之策。
另同神弓名为射日弓，巨斧名为杀神斧，一同增与伏羲用以退敌。
得到了四极的帮助，虽然没有实际性的实力改变但伏羲一方已经有了对抗的希望。
先，箭神后羿用射日弓连珠九射，射下九个太阳，解除了十日危机。
随后，炎黄二帝用利用神机所创指南车等机关，在逐鹿大破蚩尤和刑天所率魔军，一举扭转战局将敌人尽数驱往苦寒的北地。
与此同时，伏羲用尽自身在大陆之上的最后力量，借助轩辕剑的无上神力，封印烛阴化身之龙于北地承天山脉深处。
据比眼看大势已去无利可图，便撤手离去，弃烛阴于不顾。伏妾将轩辕剑托付于炎黄二人随即消散于无形。
大战结束，炎帝见大陆满目苍夷，人类疾病缠身，为救助天下百姓，改号神农游历人间尝试百草，寻求医病救人之道，最终将青轩一门扬光大。
而宛城在战火已是一片废墟鼻帝率仅存人类，南下洛水试图建立新的家园。
上古洪荒之战至此终结人们将从人类诞生到战争结束的这段时间，称为“上古纪”或“洪荒纪”。
为了纪念这不朽的战争诗篇，世人将盘古大陆改称为玄天大陆，简称“，大荒”。
黄帝率众南下建立部族，以轩辕剑为意取名为轩辕氏，并开创了空前盛世，史称“轩辕纪”或“玄天纪”。
建都于洛水玄湖两岸，取名玄天城，只为纪念轩辕氏祖伏羲，从此玄天洛水就成为了人类的代名词。
当初，人类掌握五灵法力的术者，由于能够使用五灵本源之力，能够和当初女娲所托付降世的五灵之神沟通，所以他们逐渐弃始在一些祭祀活动担任神使的角色，通过长时间的磨合，渐渐形成了以祭祀为主要活动的组织轩辕神宫。
刚开始，神宫只是负责一些祭祀活动的祭舞和神乐，正所谓“奏黄钟，歌大吕，舞云门，以祀天神”。
然而随着对五灵法力的进一步研究，结合祭祀的舞步和乐曲，轩辕神宫创造出了结合声与形的独特灵术。
如此一来，轩辕神宫名气大涨，对于人类的影响力也逐渐的扩大。