就在下游浮桥两侧激战的同时，洪承畴、陈廷谟和白广恩已经从上游渡过嘉陵江了。
洪承畴打从一开始就没指望流寇被彻底包围在嘉陵江西岸，他只是希望能消灭多少就消灭多少。渡江必定会大大削弱流寇的战斗力，这样一来，等到他在嘉陵江东岸追上流寇主力时，已经松懈下来的流寇就会被轻易冲垮，再加上川东明军和被策反的流寇两面夹击，便会取得歼灭性的战果。
李自成等人追上郭汝磐时，他刚刚才打通东边的道路。郭汝磐审问俘虏之后得知，刚才和他战斗的竟然是摇天动和黄龙的队伍，这些人从联军前队那里叛逃出来，在前去投奔洪承畴的路上正好撞上了他们。郭汝磐的兵也并非甚精，但是摇黄和刘文兴的战斗意志都很薄弱，发现很难战胜郭汝磐，背后又有敌人来袭之后，便迅速脱离接触转道向北了。
联军都来不及点数损失了多少人，迅速向东进发。高一功在后收容掉队人员，李友则去寻找王友进，这位光顾着逃命，不知道逃到哪里去了。
很快，那支出现在摇黄和刘文兴背后的队伍也来和李自成、郭汝磐会合了，居然是辛思忠和马世耀。
刘宗敏和田见秀判断对付秦良玉用不了那么多人，让辛马二将回头增援。田见秀、李过、谢君友、马重僖、杨秉胤在左，刘宗敏、袁宗第、刘汝魁、白鸠鹤、马朝兴在右，向秦良玉部再度发起了攻击。嫡系的石柱土司军队在闯军的冲击下坚守阵地，纹丝不动，然而其他七拼八凑来的队伍却抵挡不住。闯军在人数上有优势，军队水平也更高，根本不把这样的对手放在眼里。
秦良玉已经六十四岁高龄了，但这并不意味着她老迈不能战，精兵有精兵的打法，弱兵有弱兵的打法。起初秦良玉按照她原本的作战风格，以摧阵陷敌为上。然而与闯军谢君友部正面对撞之后，白杆兵一点也没占到便宜，这样以寡击众，要不是袁韬等临阵倒戈，秦良玉已然输了。
于是秦良玉改变策略，指挥明军扼守山险，节节抵抗。因为明军中有大量的本地乡勇，所以始终占据地理优势，一直挡在闯军面前。闯军虽然有野战破敌的能力，但是秦良玉把战斗变成了土司兵擅长的山地拉锯战，他们也没办法硬冲过去。
然而，又一支闯军出现在了秦良玉的背后，这场战役简直打成了俄罗斯套娃。
秦良玉从夔东回转时，留下了侄子秦翼明的兵马牵制夔东闯军，可她不知道的是，闯军的南下不是一时兴起，而是蓄谋已久，就在袁宗第出发后不久，白贵和吴汝义便带着从少室山、商洛山抽调的队伍来到了夔东。
南阳的毛葫芦已经和闯军有了密不可分的关系，任氏兄弟想翻脸也不可能了。所以闯军只要不大规模出动，小股部队的调动几乎畅通无阻。刘体纯试探着攻击了几次，发现对面的明军的反击力度大大减弱，恐怕是虚张声势。他立刻意识到恐怕是闯军主力要来了，秦良玉已经西进。三个老管队商量之后，决定由吴汝义留守夔东，继续和秦翼明对峙，刘体纯和白贵悄悄绕过明军驻地，尾随秦良玉而来。
刘白二将带的人不多，但他们在明军背后截夺粮草，攻击州县，造成了很大的混乱。秦良玉自不会怕刘体纯，可是腹背受敌的处境让她的军队根本无心再战了，各地的执掌团练的士绅和卫所军官听说流寇在背后攻击各县，纷纷要求回家。朝廷打不打李自成不要紧，我家里的钱财牲口可不能让流贼抢了去。这是大家切身利益相关的大事，秦良玉就算有通天彻地的本事，也无法禁制。
无奈之下，秦良玉只得退到了巴江和渠江交汇处的渠县县城，闯军东进的道路终于打开了。
然而，洪承畴也追到了。