遭到突然袭击的冲绳列岛一片混乱，第三舰队又趁势攻击了庆良间列岛上的庆良间机场和久米岛上的久米岛机场，除40门11式75毫米高射炮外，共击毁115架96舰战，57架96舰爆，41架96舰攻，总计213架战机，仅仅损失了1架白鹳和2架白腹鹞。()
得到急报的山本五十六忧急呕血，急忙下令驻九州岛的3支主力舰队全部南下，由于担心北方再遭威胁，没有召回北上作战的第一舰队。
23号，第三舰队攻击了粟国岛上的粟国机场，这次爆发了激烈的空战。40架96舰战被全数击落，地面的30架96舰攻也被全部炸毁，凭借数量和质量上的绝对优势，攻击机群只有2架雀鹰被击落。
上午9点，第三舰队遭到了日本海军第5潜艇战队18艘中型潜艇的攻击，经过2个小时的拼杀，台中号轻巡洋舰和易风号驱逐舰被鱼雷击沉，日本潜艇则损失了9艘。看着海面上的机群如同老鹰一般虎视眈眈，剩余的日本潜艇纷纷偃旗息鼓，丧失了继续进攻的勇气，调头撤退了。
中午12点，第三舰队的防空战斗机报告发现日本侦察机，几乎同时，黄海号上起飞的两架苍鹭侦察机也发现了日本主力舰队。
“司令，北面压过来的两支日本舰队相距只有100海里，”吴祚栋指着海图上的一块区域说道，“东边的那支舰队有航母9艘，重巡洋舰4艘，轻巡洋舰和驱逐舰大约40艘。西边的那支舰队有战列舰和重巡洋舰10余艘，轻巡洋舰和驱逐舰大约30艘。”
“好大的两盘菜啊，我们哪一盘都吃不下。”伍世显苦笑道，“立即转向东南与快速舰队汇合，命令防空战斗机将防卫圈向外扩展30海里，击落所有被发现的日本侦察机，防空战斗机增派一倍。”
第三舰队主力和快速舰队汇合后，并没有继续向东南方向继续撤退，而是向东北方向转进。
“将军，我们派出的攻击机群未能找到新唐舰队，与侦察机也失去了联系。”作战参谋小声说道。日本第三舰队司令山县正乡中将沉吟半晌，“放出舰队所有侦察机搜索一切可能的海域，，请求邻近的第二舰队与我们拉开距离，协同搜索。”
24日，正当日本舰队在庆良间列岛以南海域进行搜寻的时候，第三舰队的机群轰炸了北面德之岛上的机场，击落与炸毁95架96舰战和100门11式75毫米高射炮，自身损失了6架飞机。
得到消息之后，附近冲永良部岛上的陆军航空兵出动了30架95式战斗机和50架96陆攻前往轰炸新唐舰队，在新唐海军空海优势火力的夹击下，性能落后的80架飞机被全部击落，没有取得任何战果。而冲绳群岛和奄美群岛上所有的鱼雷艇和潜艇部队都接到了死命令——不惜一切代价拖住新唐舰队。可是已经太晚了，第三舰队已经从冲永良部岛和德之岛之间穿穴了过去，还顺手搞掉了冲永良部机场上剩余的20架95式战斗机。
1月26日，6点36分，在福江岛以南150海里处，第三舰队遭到了自福江岛机场起飞的三波次总共220架95式战斗机和96式陆上攻击机的攻击。经两个小时的激战，共击落日本飞机196架，第三舰队两艘驱逐舰被炸沉，数艘军舰被炸轻伤，损失雀鹰4架。