而唐宋元以后，内丹术几乎一统天下。内丹也被称作金丹，金是指坚刚永久不坏之物，用来比喻炼成金丹后可以让人长生不死。
《金丹论》有云：
“金者，坚刚永久不坏之物；丹者，圆满光净无亏之物。古仙借金丹之名，以喻本来圆明真灵之性也。
此性在儒则名太极，在释则名圆觉，在道则名金丹。名虽分三，其实一物。
儒修之则为圣，释修之则为佛，道修之则为仙。三教圣人皆以本来真性为成道之本也。
愚人不知，或用五金八石煅炼成药为金丹者，非也；真性在大造炉中，经火煅炼成熟，与天地同长久，与日月同光明，岂凡世有质之物能成哉？”
此论熊清浦并不完全赞同，因为此论的作者太偏于心性方面，认为金丹就是“圆明真灵之性”，太过偏颇。
吕祖有诗云：“修性不修命，万劫阴灵难入圣。”熊清浦很赞同这一点。圆明真灵之性修得再好，也是阴灵，没有物质实体支撑，无法长生。
佛门就偏重于修性，专门修出一个比较难以朽坏号称不灭的意识体，但是要脱离肉身到纯精神的世界极乐世界或者依附于物质世界中的贵金属塑造的“金身”上。
而道门性命双修，修出的“圆明真灵之性”依托于由自身精气结合天地灵气炼成的介于虚实之间的仍具有物质性的先天元炁。
二者结合形成金丹，此金丹既坚固难坏，而且温养成元胎或者元婴后，还可以载着元神脱离，再经过炼神返虚的功夫，就成为天仙，相当于再造一具先天元炁构成的可以长存不坏的身体。
所以这个《金丹论》并不完全正确，但他至少说明，金丹不是外在的药物矿物可以炼成的纯物质的丹丸。也不是如同熊清浦之前想的用真元凝聚成固态的的丹丸。
它还必须赋予“圆明真灵之性”才行，而且真元的性质也必须进行一次质的转变和飞跃。这样修成的金丹才是可以让人成仙的金丹，也才是可以长存不坏的金丹。
也许有什么方法可以将真元凝聚成实质的固态丹丸，但这种内丹一样无法使身体长存不坏。
因为修炼内丹想获得长生不老的理论是“顺则成人，逆则生丹”。
如同元代陈致虚在《金丹大要》里说的那样：“是皆不外神气精三物，是以三物相感，顺则成人，逆则生丹。何为顺？一生二，二生三，三生万物，故虚化神，神化气，气化精，精化形，形乃成人。何谓逆？万物含三，三归二，二归一，知此道者怡神守形，养形炼精，积精化气，炼气合神，炼神还虚，金丹乃成。”
熊清浦对此的理解是，可能整个宇宙有一种最高层次的物质或者能量，但是无形无质，却构成宇宙万物的本源。
这种东西道家叫做“虚”或者“道”，现代科学叫“以太场”，佛教叫做“阿赖耶识”，儒家称作“天命”或者其它东西。
这种东西会自然演化出人的精神意识一类的存在（即元神之力），精神意识一类会演化为气这种介于物质和精神之间的存在（即元炁），气这种存在演化为精，即构成人体生命的精微本源的父母赋予的先天物质及能量精华，跟人的生zhi器产生的生命精华本质上是一样的，而精结合其它五行物质又演化成人体。
这就是道生一、一生二、二生三、三生万物在人身上的解释。因为按照道门传统的“人身一小天地”的天人合一论，人的生命之形成，亦如道、真气之造化天地。
而修炼内丹就要逆转这个过程，因为宇宙中物质是不可能长存不坏的，精神体可以长久一些，但也不可能永久不坏。
而且精神体是阴性的，没有物质依托，有种种缺陷，在阳性的物质世界中无法直接显现。
只有回归大道本源，才能长存不坏。所以修道要求筑基，然后炼精化气、炼气化神、炼神返虚、炼虚合道。
熊清浦根据自身实践，他对此的通俗化理解是：筑基就是将身体改造得可以吸收天地灵气或者改造得能够将自身的生命精华炼化成父母赋予的先天之气。
炼精化气就是将自身生命精华炼成先天之气，同时借助这个先天之气将天地灵气同化为先天之气。
炼气化神是将先天之气炼化为元神之力，炼神返虚是将元神之力炼化为大道本源的物质或能量。
而炼精化气分成几个阶段，第一阶段是将“精”炼化成先天之气，这就是熊清浦真气化成真元的阶段。
其实人体自身的精只能作为引子和炉鼎，起到转化、同化所吸收到的天地灵气的作用。
不然光凭人的精完全炼成气也没有多少，这就是宋元以来，因为天地灵气太过稀薄，虽然金丹术很成熟，却很少有金丹有成者的原因。
因为是末法时代，熊清浦为了改造身体，还经历过一个属于练武阶段的将水谷精气转化成后天真气的筑基前的阶段。
第二个阶段是将真元转化成金丹。真气到真元发生了质的转变，同样要将真元结成金丹，也许要质的变化。
而这种质变是将与父母赋予的先天之气同质的真元转化成父母未生前的真阴、真阳和合的物质，也是可以转化成元神之力的物质。
这种物质可以叫先天元炁。
而什么是真阴真阳呢？钟离权认为：“阳中藏阴，其阴不消，乃曰真阴”，“阴中藏阳，其阳不灭，乃曰真阳”。人亦各以禀自父母真气的真阴真阳为性命之本，元阳真气藏于肾府，元阴真液源于心海。”
也就是如同太极图表示的那样，阳鱼中的鱼眼部分就是真阴，阴鱼中的鱼眼部分就是真阳。
而炼金丹的过程就是采得肾府和心海中的真阴真阳和合熔炼而成构成金丹的丹元之力。
也就是说炼金丹需要人的真阴真阳的真种子为引，所以《悟真篇》里说：“人人自有长生药，自是迷徒枉把抛。”
所以，熊清浦的真元力不断增长，但是没有这点真种子，却总也结不了丹。
但是光有这点真种子远远不够，因为同样的道理，人体的真阴真阳也是有限的，光有这点真阴真阳和合而成的丹元力远远不够成仙了道，还须继续吸收炼化天地灵气。
不过，这点真种子却是最为重要的，没有他炼金丹只是“水中捞月”，吸收再多天地灵气也没用。
即便强自结成丹丸，也不能长存不坏，因为真元力虽然已经比普通物质高了两级（之间还有后天的真气），但也只是与父母赋予的先天之气一个等级，自然不可能长存不坏。
那为什么修炼金丹还必须有心性的修炼呢？<div>