西南纷扰不定，关外也发生了变化，先是黑龙江，然后是吉林。
黑龙江的督军兼省长毕桂芳，原是旗人，后来改入直隶籍，是个外交人员出身，曾担任清国驻俄公使馆随员。
毕桂芳两大特色，一是怕太太，唯太座之命是从：一是万事不打理，绰号“毕不管”。他虽然万事不管，可是他有官运，官运亨通，
一步一步爬到了黑龙江省长地位。袁世凯去世时，黑龙江将军朱庆澜被军务帮办逐走，段祺瑞便以省长毕桂芳兼署督军。
6年6月，督军团纷纷独立时，黑龙江军务督办许兰洲也宣布独立，他不是对〖中〗央，而是对毕督军。毕桂芳向他进行商谈，愿以省长相让而留任督军。许的意思也想要督军，以讨价还价，结果许愿任省长兼师长，但又听说毕调兵自卫，马上翻脸，限毕24小时内离省。
段内阁对毕、许之争本无所谓，亦无心袒毕，但他不欢喜犯上作乱，所以电召许入京一谈。许回电说：“黑龙江有两个宗社党徒，是毕桂芳和巴英额，职须留此扑灭匪类”。
毕桂芳发表寒电下野，推许代理，段祺瑞并不接受毕的推举，6年7月26日，发表鲍贵卿为黑龙江督军，命许仍回帮办原任。许赶走了毕桂芳，自己却登不上督军宝座。
鲍贵卿是安徽人，和段祺瑞同乡，又是奉天督军张作霜的亲家，从此黑龙江便成为“奉天王国”的属地了。
10月18日，北京政府调任吉林督军孟恩远为诚威将军，调察哈尔都统田中玉为吉林督军，以张敬尧继田中玉为察哈尔都统。孟恩远字曙村，天津人，小站练兵入伍，104年任吉林巡防军管带，民国2年逐走吉林都督陈昭常，取得吉林省军政大权。督军团闹事时，他因年龄最长而被推为领衔人，大家尊呼他为孟大哥。他也和毕不管差不多，会写一个“虎（www.shuxie8.com）”字，督署的事，内事交给女婿陆承武，外事交给外甥高士缤，高是督署参谋长。孟大哥的调动，是和张作霜有关的，据说张作霜检举孟在复辟时期曾接受吉林巡抚伪职。事实上张作霜这时已是关外王了，自不愿意吉林有这位老大哥在卧榻之傍。
孟恩远早听到一些风声，曾派秘书戴艺篑到北京冯国璋处打听虚实，冯说没有这回事，劝孟不要听谣言。可是不久谣言成了事实，孟接到命令后大为光火，便打电报质问内阁调动的理由，限三日内答复，否则吉林便宣布自主。
段祺瑞正全力对付南方，所以希望东三省不要出麻烦，他打算提升张作霜为东三省巡阅使，由他处理吉林督军，升任第2口师师长吴俊升为黑龙江督军。
集北战争一触即发祺瑞向湖南用兵时，冯、段之间的分裂表面化了。冯国璋不同于黎元洪的是他在北洋军系中有地位，有兵权，还有长江三督为后盾。
冯国璋的第一道本钱是江苏督军李纯，冯国璋做了总统后，曾表示尊重责任内阁制，对于段用人行政和决策的决定都不干涉，段祺瑞对冯国璋在态度上也比对黎元洪时好得多。可是他们是两个实力派，冯国璋颇有心机，段祺瑞则刚愎自用，冯国璋当然不愿意做一个和黎元洪一样的受气总统，段祺瑞则决不肯放弃半点权力，因此两人的争执，一样尖锐化。
争执的第一遭，是军权，这也是历来总统、〖总〗理间的争执焦点。冯就任不久，就想恢复“大元帅陆海军统率办事处”段当然不肯同意。
段在国务院设立了“参陆办公处”以取代袁世凯时代的“统率办事处”。
冯要过问全国大事，不愿做有名无实、像个泥塑的大总统，段在这一方面总算让了步，自6年10月8日起，每天派一位官员向总统报告政情。
可是，总统、〖总〗理之争，不是表面的，或是一件事情上让一点步就可以和缓，于是权力之争使这两位北洋巨头，裂痕愈来愈大……
北京方面钩心斗角，广州方面也乱了起来！
在广州军政府成立后，孙中山曾令邓耀为广东招抚局长。12月4日，孙中山饬令邓耀停止招抚，所有该局派出人员悉数撤回。为扩充军政府军队，孙中山还派出专员到粤省各县征募民军。